这本《发酵文化人类学》是一本发酵学侦查笔记。身为发酵设计师的小仓拓在日本各地展开侦查，以发酵学家的眼睛进行观察，并用人类学家的头脑挖掘它们的文化含义。通过对面包、酸奶、酱油等发酵食品历史的介绍，发酵文化地图的铺开，他为读者展现了日本各地农业的发展历程，以及人体内部肠道菌群的秘密。小仓拓认为，文化的本质是隐蔽的，肉眼不可见的微生物作为自然界里的信使，可以将这些文化的“秘密”讲述给人们听。
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